Всего 6 инфекционных отделений. Внутренняя планировка всех клинических отделений является идентичной. При входе в каждое отделение предусмотрены санпропускники. В каждом отделении предусмотрены все необходимые функциональные помещения. На первых этажах палаты представлены боксами,  которые обеспечены непосредственным выходом наружу (улицу) через тамбуры.  На 2 и 3 этажах палаты представлены полубоксами. Кроме того, в каждом из боксов и полубоксов предусмотрены  такие помещения, как тамбур, шлюз, палата и санузел. Площадь каждой палаты составляет 50 кв.м. В каждом боксе имеются консоли с подводкой газов. Бокс оснащен кнопкой вызова медсестры. Согласно санитарным нормативам предполагается полная изоляция больных; все процедуры, манипуляции, кормление будет производиться в боксе. Учитывая, что свидания в инфекционном стационаре не предполагаются, блоки оснащены  системой  видеосвиданий по скайпу.  Для этого в каждом боксе установлен монитор. Ежедневно по монитору демонстрируются видеоролики санитарно-просветительного содержания для ухаживающих, а также мультипликационные фильмы для детей.

Кроме того, на этаже имеется 2 поста, на каждый из которых выведено видеонаблюдение с палат. Медсестра со своего рабочего места может следить за всем, что делается в боксе, каково состояние  детей.

Общая планировка этажа  состоит их 4-х отдельных отсеков, по типу «бабочки»,  по 4 бокса в каждом.   Для удобства  видеонаблюдения на каждом этаже имеются видеокамеры. Вся информация с камер концентрируется на большой экран в центре оперативного управления.