1-қабат – бактериологиялық зертхана
2-қабат – клиникалық-диагностикалық зертхана
3-қабат – иммунологиялық зертхана.
2016 жылдың тамыз айында стационардың зертханалық қызметі (клиникалық-диагностикалық, бактериологиялық зертханамен бірге иммунологиялық) Қазақстан Республикасы ҰЭМ Тұтынушылардың құқықтарын қорғау комитеті «Астана қаласының тұтынушылардың құқықтарын қорғау департаментінің» Қазақстан Республикасы ҰЭМ Режимдік комиссиясының 5 жыл мерзімге патогенділіктің III-IV топтардағы микроорганизмдермен микробиологиялық зерттеулер жүргізуге 2016 жылғы 02 тамыздағы №79 рұқсатын алды.